人体解剖学有时真让人感到迷惑：随着科学的进步，科学家在两性特征的确定方面越发感到困难。遗传学家甚至预言Y染色体最终会灭绝——
从我们的幼年时代起，性之差别的秘密就开始使我们困惑。这个秘密甚至从蒙昧时代起就让博学的人感到烦恼：为什么人类有两种性别？男女两性真正的差别在哪里？男女状况是否在解剖上、在基因上、在大脑方面有不同之处？男女的不同状况是否由环境和社会习俗造成的？
近几年来，遗传学家、人类学家、医学图像专家为回答上述问题提供了新的材料。他们的发现提供给人们一幅越来越复杂的性别图，原先确定的性别边界已经变得越来越模糊了。
原先区分某人性别的标准现在也变得越来越不明确或者有争议性。人们甚至不知道该如何来界定性别。通过两性的不同的生殖器官不是可以区分性别吗？但是，确实存在具性别属性的两性人，他们同时是男人也是女人，或者只是初步显露某一种性别的特征。在欧洲，平均每5000人中就有1人属于男女间性；通过两性的不同的荷尔蒙不是可以区分性别吗？然而，荷尔蒙不仅不再是某种性别特有的：女体也能生成睾酮，而男体也能生成雌激素。通过不同的遗传基因不是可以区分性别吗？但是，某些男性同样具有两个X染色体，而某些女性同样具有Y染色体，在法国有20万以上的人具有“不同于”其体形的遗传性特征。通过不同的骨骼形状是否可以区分性别？今天的古生物学家承认，要区分骨骼在性别上的差别是很难的。男女在身体能力方面是否有差别呢？然而，在运动场上，男女运动员在身体能力上的差别正趋于缩小，美国加利福尼亚大学对1920年以来的奥运会纪录所做的一项研究表明：女性田径运动员在速度方面的进步比对应的男性运动员快2倍，并且预测，按照这样的进度，到2050年男女田径运动员在速度上的差异将会完全消失。
两性在大脑方面是否有显著的差别呢？男性之所以在自然界占有优势，男性大脑体积一般比女性的大可能是一个原因。20世纪初，法国哲学家古斯塔夫 · 勒邦(Gustave LeBon)认为：“女性的三心二意性、不坚定性、缺乏逻辑性、推理能力低之特性”与她们的脑颅体积小有关。100多年过去了，尽管科学和精神面貌的进化在发展，但是人们仍然或多或少地赞同这位哲学家的观点。2005年1月，哈佛大学校长劳伦斯 · 萨摩斯(Lawrence Summers)在全美国发起一场大规模论战，在讨论过程中，他对在科学领域女性相对少的现象做了这样的解释：女性很可能本能地在数学方面缺乏天赋。
关于这个问题，确凿的科学论据不是很多，矛盾不少，而且经常是非直接的，因为这些论据所针对的行为极可能与生物有关，而并不取决于社会。从统计的观点来看，女孩的大脑体积确实较小，爱因斯坦和法朗士(Anatole France)的大脑体积也不算很大。但他们的大脑重量为1600多克，而男性平均大脑的重量为1300克。女性大脑灰质区比例较大，且具有胼胝体(即连结左右两侧大脑半球的神经纤维束)，女性的胼胝体比男性的厚，而较厚的胼胝体能使两个大脑半球联系更佳。女性的语言区分布在大脑两侧，而男性的左半球语言区活动明显侧性化。因此男性有较强的空间感，而女性则有较强的语言能力且表现出较明显的情感同化，她们较能察觉他人的情感和心态。
总的来说，没有足够的证据能够清楚地说明两性在认知方面存在差距。智商测试没有显示出智力的差距与性别有联系，只是特别聪明者和特别低能及迟钝者多为男性。于是，两性的智商在总体上保持平衡。英国剑桥大学孤独研究中心主任西蒙 · B · 科恩(Simon Baron Cohen)认为：“两个个体之间的差距要比两种性别之间的差距更为重要。”
虽然两性的大脑没有真正的区别，但是大脑仍旧控制着人与性别有关的偏好和行为。1991年，加利福尼亚州的科学家西蒙 · 勒维(Simon LeVay)在同性恋者的大脑中发现了一个解剖特征：同性恋的男性以及女性的丘脑下部的一个区域其容量还不足异性恋男性的一半。2年以后，法国国立癌症研究所的德昂 · 阿梅尔(Dean Hamer)博士声称：发现X染色体上有一个叫“XQ28”的区域，它掩蔽了同性恋者的基因。不过勒维的观察目前没有被证实，阿梅尔的“XQ28”区域同样也没有得以验证，因为缺乏在人的胚胎中检验人类基因效果的实验。但是，科学家将这样的实验在果蝇身上进行。奥地利科学院的遗传学家在果蝇身上找到决定动物性行为、动物求偶和交配方式的DNA碎片。2005年6月，他们在雌蝇卵上注射了基因的雄性副本，结果成功地将雌蝇的偏好反向：雌蝇开始喜欢追逐同性。
性别差异最终是否依赖于遗传呢？美国杜克大学的科学家经过对两性基因的研究，于2005年3月得出结论：男性和女性的基因中有300个不同，约占遗传型基因的1%。决定性别的基因数量差别看上去很小，但是你要知道人类基因与猴子基因之间只有1. 5%的差异。
最新的遗传学研究结果告诉我们：人类中女性比男性早出现84000年，与《创世纪》中所叙述的情景相反。斯坦福大学的一个遗传研究小组运用“分子钟”方法证明了：人类诞生之初仅有一种性染色体，即每一对染色体都是相同的，这种染色体同时具有男性和女性的基因。
但在25000年前，人类基因发生突变后，染色体中的某一个开始分化，并产生Y染色体。Y染色体在与它的孪生体交换基因时，无法再重组，因为Y染色体总是独自在细胞中，使之变得越来越贫乏。直至今天，Y染色体仍是基因组中最小的、能提供的基因最少，还不足100个；而X染色体能提供的基因达到2000个。据英国遗传学家布莱恩 · 赛克斯(Bryan Sykes)的估计，这种决定男性性别的染色体终将要消失，......125000年后，男性将失去生育能力。
自从发现了人类性别决定于染色体以后，生物学家始终没有停止寻找决定性别的基因(在孕期的第5周将决定胎儿性器官的形成)。20世纪90年代初，英国伦敦的一个研究小组在经历了无数次失败后，终于在一位受试者的Y染色体深处发现了一种叫“性决定区”的基因，它构成了男性特征的关键。几个月以后，该小组将“性决定区”的一个复本注射到一个雌性鼠胚胎，结果成功地改变了它的性别，从而无可争辩地证实了“性决定区”机制的存在。1994年，意大利帕维亚大学的基因学家证实了女性特征决定机制的存在，他们发现，X染色体上存在着一个与男性特征阻遏蛋白相似的基因。但是，这个发现似乎并未引起人们注意。但人们很想知道其中的原因。
尽管Y染色体似乎必定要灭绝，但是X染色体仍然有不断兴旺的趋势。两性共有的X染色体携带着大量与大脑功能有关的基因。过去人们以为：女性染色体中的两个X中，只有一个在起作用，另一个处于沉默状态。但是，最近人们发现，以前的认识是不全的，应该是25%的沉默着的X基因实际上是活跃的，它使得细胞可以修复在复本替代的过程中那个变得脆弱的基因。于是，这种基因可变性使得“脆弱的”性在面临突变时得到较好的保护，并使其增强适应能力。基因可变性还使得“脆弱的”性避免受与X染色体基因有关联的遗传型疾病。
有一个事实是确定的：从长远来看，生物进化似乎有益于女性，这里指的是生育方面，而生育是已经明确了的最后一个女性特性。哲学家和生物学家亨利 · 阿特朗(Henri Atlan)在他的著作《人造子宫》中写道：“从现在起至50年以后，婴儿出生可以通过体外繁殖来实现，技术的发展已经可以让胚胎在母体外发育。”人类已经开始将繁殖代客加工技术和试管授精技术投入运用。在美国，康乃尔大学的生物学家海伦 · 休格(Helen Huang)和钦 · 利厄(ChingLiu)将完成把人的胚胎植入一个子宫代用物中，然后对内添加荷尔蒙以及营养物质；而未来的男性在授胎过程中的作用将变得无足轻重。2002年，日本东京农业大学的生物学家成功地在实验室里实现用两只卵子授胎出一只老鼠，即整个实验过程没有使用精子。照此下去，女性还将会是女性吗？
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平均寿命：生活在地球上的人类平均寿命女性为65年，男性为62年。在法国，女性的平均寿命高出男性10%。
骨质疏松状况：绝经后的女性比过了更年期的男性失去更多的骨质。
对乙醇的敏感性：同样体重的女性和男性摄入同量的酒精后，女性醇血度高于男性。
免疫系统：女性的免疫系统强于男性，但是女性更容易患自身免疫性疾病，如类风湿性关节炎、狼疮、硬皮病或者多发性硬化症。
患抑郁症的可能性：女性精神沮丧者的数量是同样状况的男性的2至3倍，因为女性大脑产生的血清素较少。
大脑重量：女性大脑的平均重量比男性轻5%至10%，但是女性大脑的密度较之男性的大一些，女性大脑灰质比男性的多出15%。
平均收入：法国男性平均月收入1151欧元，女性平均月收入841欧元。
身高和体重：法国女性平均体重64千克，男性平均体重77千克；法国女性平均身高1. 62米，男性平均身高1. 75米。
人口统计：地球上出生的男女婴儿平均比例为105：100，由于第一胎婴儿的死亡率高于第二胎，在140个国家里，成年男女人数比例为99. 89：100(2000年)